스카이블루 컬러는 꿈과 희망이 가득한 무한의 창조적 공간인 하늘을 나타내며 예술적 창의성이 가득한 과학영재들의 꿈과 희망,미래 비전을 나타냄. 다크블루 컬러는 글로벌 리더의 창의성, 전문성을 갖춘 미래인재의 무한한 가능성나타냄 영문SASA는 목표와 정상을 향해 오르는 계단의 형태로 표현하여 창의적인 글로벌 인재양성을 위한 최상의 교육시스템을 만들어가는 학교를 의미함.
교목
느티나무는 수명이 길고 그늘이 넓어 예로부터 우리 민족에게 쉼터가 되어준 친근한 나무로 세상에 도움이 되는 인재를 뜻하며, 뿌리가 깊어 가지고 사방으로 뻡어 거목으로 자라므로, 세상을 이롭게 하는 글로벌 리더로 성장해 나가는 세종과학예술영재학교의 학생을 상징함.
교화
꽃말은(기쁜소식) 또는 (신비로움 사람) 물을 맑게 정화하는 역할을 하며 오므렸을 때 붓의 모양과 같아서 붓꽃으로 불리움. 만개했을 때 다양한 색깔을 나타내는 꽃으로 학생들이 학문을 배우고 익혀서 다양한 방면에서 역량을 발휘하는 인재로 성장하는 것을 뜻함.